Hastane, 2020 yılında meydana gelen Elazığ Sivrice merkezli 6,8 büyüklüğündeki deprem ile Kahramanmaraş merkezli depremlerden etkilenmedi. Son olarak Malatya'nın Kale ilçesinde gerçekleşen 5,9 büyüklüğündeki depremde de izolatörler devreye girerek hastanenin hasar almasını engelledi.
Depremlerden etkilenmeyen hastane, yaralılara ve hastalara güvenli bir şekilde hizmet sunmaya devam ederek, herhangi bir aksama yaşanmadan çalışmalarını sürdürüyor. Elazığ Fethi Sekin Şehir Hastanesi, sismik izolatörleri ile depreme karşı güçlü bir koruma mekanizması oluşturmuş durumda.